Если арендовать оборудование с персоналом?

Да, тогда к владельцу оборудования и персонала вообще вопросов на будет.
Насчёт хранения, если ДМ у Вас учтены, то Вы сами выбираете способ хранения ДМ, обеспечивающий их сохранность. Требования к учёту одинаковы что для ИП, что для ООО, что для ГП. Если ДМ у Вас не учтены, то они хранятся незаконно.
Обычная последовательность контрольных (оперативных) действий такова:
- документируется факт наличия ДМ;
- истребуются документы первичного учёта на получение и передачу ДМ организацией, а также документы производственного учёта в организации;
- составляется баланс движения ДМ за проверяемый период по результатам которого выявляются излишки-недостачи ДМ;
- выявленные недостачи-излишки категорируются по признаку ювелирные-неювелирные;
- принимается решение о наложении административных или уголовных санкций.
Так что если Вы осуществляете деятельность с драгоценными металлами, то как самый минимум имейте все документы первичного учёта на их получение - передачу, то есть товарно-транспортные накладные.