Есть ограничительные планки на столе, блок из которого режут кобылу тоже имеет определенные размеры. Зная размеры блока не сложно просчитать где в нем находится кобыла, а следовательно и где находится "0"
А для фрезеровки на торцах используется выборка на фальшстоле. Таким образом, проблем в несовпадениях координат нет, так как и выборка, и вставленная в нее заготовка и УП таким образом связаны одной системой координат.